Cytoscape - Estandar para el manejo de redes biológicas. Muy ampliable a traves de plugins.
- Plugins para Cytoscape usados en el curso (copia local).
Biolayout-java - Más ligero y facil de usar que Cytoscape.
Graphviz - No tan interactivo. Para generacion automática (no interactiva) de grafos.
CellDesigner - Simulacion cuantitativa de redes de regulacion.
- Modelos usados en el curso: cascada.xml, simple.xml, fflc.xml, fflic.xml

Redes Biológicas y Biología de Sistemas