EVA results for 1kkx:A

DATE : 2002_07_17
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10.
seq	NNKQYELFMKSLIENCKKRNMPLQSIPEIGNRKINLFYLYMLVQKFGGADQVTRTQQWSMVAQRLQISDYQQLESIYFRILLPYERHMISQEGIKETQAKRI
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHH-----HHHH---HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------
apssp	----HHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH---HHH------HHHHH----	-4.2	-4.6	-0.25
apssp2	--HHHHHHHHHHHHHHHH--------------E--HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH--	-2.0	-12.6	-0.09
jpred	----HHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHH---HHHH----HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------	+14.3	+27.9	+0.15
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHH---	+10.4	+7.4	+0.05
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHH---	+6.9	+4.4	0.00
prof_king	--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHH---	+6.8	+5.1	+0.02
profsec	--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHH----EEEE---HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH--	+4.6	+6.2	-0.00
prospect_secstruc	--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHH---EEEEE-HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH-	+4.8	+3.5	+0.01
psipred	--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHH-----	+8.3	+3.7	+0.12
samt99_sec	--HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------EE-HHHHHHHHHHH----HE-HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-HHHHHH--------HHHHH	+1.9	-0.1	-0.08
sspro2	--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHH--HHHH--HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHH---	+6.3	+6.5	+0.04
prospect	--HHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHH---EEEEE-HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH-	+4.7	+3.7	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva