EVA results for 1k3k:A

DATE : 2002_04_10
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,.
seq	MDEDVLPGEVLAIEGIFMACGLNEPEYLYHPLLSPIKLYITGLMRDKESLFEAMLANVRFHSTTGIDQLGLSMLQVSGDGNMNWGRALAILTFGSFVAQKLSNEPHLRDFALAVLPAYAYEAIGPQWFRARGGWRGLKAYCTQVLT
dssp	----------HHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH-HHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-HHHHHHHHH-HHHHHH----HHHHHHHHH---
apssp	---------HHHHHHHHHH------------------EEHH-----HHHHHHHHHHHHEE------HH---EEEEE------HHHHHHHHHHH--HHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHH-------HHEEEE-E-	-7.0	-10.1	-0.19
apssp2	--------HHHHHHHHHHH-----HHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH-HHHHHHH-----EHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---HHHHHHHHHHH--	+3.0	+5.9	-0.11
jpred	-------HHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH---------EEHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH----HHHHHHH-----	+8.8	+18.5	-0.00
phd	------HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---HHHHHHHHHHH--	+7.8	+8.3	-0.05
phdpsi	------HHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---	+5.6	+8.4	-0.05
prof_king	------HHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH--------EEHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH---	+2.6	+9.0	-0.11
profsec	-------HHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---	+6.9	+8.7	-0.02
psipred	-------HHHHHHHHHHHH-----HHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH--	+0.5	-1.6	-0.10
samt99_sec	--HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH-----	+5.2	+5.2	-0.07
sspro2	-------HHHHHHHHHEHH-----HHHH-----HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH---------HHHHEHEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---HHHHHHHHHHH--	+3.5	-1.5	-0.02

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva