EVA results for 1jgs:A

DATE : 2002_01_02
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,...
seq	LFNEIIPLGRLIHMVNQKKDRLLNEYLSPLDITAAQFKVLCSIRCAACITPVELKKVLSVDLGALTRMLDRLVCKGWVERLPNPNDKRGVLVKLTTGGAAICEQCHQLVGQDLHQELTKNLTADEVATLEYLLKKVLP
dssp	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH--E-HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEEEE-------EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH----
apssp	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHH-HHH------HHHHHHHHHE-HHHHHHHHHHHHH---EEE---------EEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH---	+11.9	+15.7	+0.14
jpred	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EEE--------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--	+10.9	+20.2	+0.15
phd	--EEEE----EEEEHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHEEEEEEEE---HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE------EEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH--	-5.5	+8.2	-0.12
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEE-------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH---	+11.6	+21.9	+0.21
profsec	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEEE-------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---	+10.8	+18.7	+0.21
samt99_sec	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--EEE--------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-	+8.6	+16.3	+0.15
sspro2	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEE--------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--	+7.3	+16.6	+0.09
prof_king	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EEE-------EEEEEEE-H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--	+8.3	+6.1	+0.11

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva