EVA results for 1j5s:A

DATE : 2002_07_17
TYPE : sec
NRES : 451
HEADER : ISOMERASE
COMPND : 2 MOLECULE: URONATE ISOMERASE;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: THERMOTOGA MARITIMA;
AUTHOR : JOINT CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18...,....19...,....20...,....21...,....22...,....23...,....24...,....25...,....26...,....27...,....28...,....29...,....30...,....31...,....32...,....33...,....34...,....35...,....36...,....37...,....38...,....39...,....40...,....41...,....42...,....43...,....44...,....45
seq	HMFLGEDYLLTNRAAVRLFNEVKDLPIVDPHNHLDAKDIVENKPWNDIWEVEGATDHYVWELMRRCGVSEEYITGSRSNKEKWLALAKVFPRFVGNPTYEWIHLDLWRRFNIKKVISEETAEEIWEETKKKLPEMTPQKLLRDMKVEILCTTDDPVSTLEHHRKAKEAVEGVTILPTWRPDRAMNVDKEGWREYVEKMGERYGEDTSTLDGFLNALWKSHEHFKEHGCVASDHALLEPSVYYVDENRARAVHEKAFSGEKLTQDEINDYKAFMMVQFGKMNQETNWVTQLHIGALRDYRDSLFKTLGPDSGGDISTNFLRIAEGLRYFLNEFDGKLKIVLYVLDPTHLPTISTIARAFPNVYVGAPWWFNDSPFGMEMHLKYLASVDLLYNLAGMVTDSRKLLSFGSRTEMFRRVLSNVVGEMVEKGQIPIKEARELVKHVSYDGPKALFF
dssp	------------HHHHHHHHHH----EEE------HHHHHH------HHHHH----HHHHHHHHH----HHH------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH--EEEEE--E------HHHHHHHHH----EEE--E--HHHH------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE-EE----HHHHHH--------EE-----HHHHHHHHHHH------EEEEE--HHHHHHHHHHHHH---EEE---------HHHHHHHHHHHH----HHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-
apssp	-HHHH-HHHHHHHHHHHHHH------E---------HHHH-------HHHHH----HHHHHHHHH----EEEE-----HHHHHHHHHHH---E-----HHHHHHHHHHHHHHHEE----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHH---EEEEE------HHHHHHHHHH----EEEE---------E------HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------EEE-HHHHHHHHHHHH----E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHEHHHHH----HHH-------------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE------HHHHHH-----EE----EE-------HHHHHHHHE-EHHHHHHH-E-----EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHE------E--	-5.1	-0.2	-0.19
apssp2	------------HHHHHHHHHHH---EE-------HHHH--------HHHHH-----HHHHHHHH-----HH-------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-----EE----HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--EEEEEE-------HHHHHHHHH----EEEE--------------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------EEEE--HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE--------HHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHH----EE-----E----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH--HHHH--	-1.8	+2.4	-0.11
jpred	-------HHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHH------HHHHHH---HHHHHHHHH----EEEE------HHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHH---EEE-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHH--EEEEE-------HHHHHHHHH-----EEEE----------------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------EEE-HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH---HHHHEE------------HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-----EEEEE--------EE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE-----EEE----HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH----------	-0.6	+5.7	-0.10
phd	------HHHHHHHHHHHHHHHH-----E-------HHHHH---------EEEE----HHHHHHHH----EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EE-------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--EEEEE-----HHHHHHHHHHHH----EEEEE--------------HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-------HHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE----HHHHHHHH-HHHHH------E----HHHHHHHHHHHHH---EEEEEEE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+8.6	+12.3	+0.08
phdpsi	------HHHHHHHHHHHHHHHH-----E-------HHHHH---------EEEE----HHHHHHHH----EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EE-------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--EEEEE-----HHHHHHHHHHHH----EEEEE--------------HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-------HHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE----HHHHHHHH-HHHHH------E----HHHHHHHHHHHHH---EEEEEEE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+5.1	+9.3	+0.03
prof_king	-----------HHHHHHHHHHH-------------HHHHH-------HHHHE-----HHHHHHHH---EEEE-------HHHHHHHHH---HH------HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH---EEEE------H-HHHHHHHH-----EEE----------------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------EEE---HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE---------HHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHH-----EEEEE------HHHHHHHH----EE------------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHH------HEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH------HH---	+5.0	+9.4	+0.03
profsec	-----------HHHHHHHHHHH----EE-------HHHHHH------HHHHH----HHHHHHHHH-----EEE------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---EEE----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH--EEEEEE-------HHHHHHHHH-----EEE------------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------EE---HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE--------HHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE----HHHHHHHH-----EEE---EEE---HHHHHHHHHHHHHH--HHHEE-EE-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH---HHHH--	+7.2	+9.2	+0.10
prospect_secstruc	-----------HHHHHHHHHH--------------HHHHH-------HHHHEE----HHHHHHHH-----EE-------HHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--EEEEE--------HHHHHHHH------EEE-------EE-----HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEE-HHHH----HHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE-----HHHHHHHH-----EE--EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-------	+8.1	+15.3	+0.03
psipred	-----HHH---HHHHHHHHHHH----EE-------HHHHH-------HHHHH-----HHHHHHHH----HHH------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH---EEEEE-------HHHHHHHH-----EEEEE--------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH----EE-------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---------HHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE-----HHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+7.6	+8.8	+0.1
sspro2	-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHH--------EEEE----HHHHHHHHH----HEE-------HHHHHHHHHH--H------HHHHHHHHHHH--------H--HHHHHHHHHHHH----HHHHHHH--EEEEE--------HHHHHHH------EEEE-------EEE-----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E---------EEE--HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEHHHHH---HHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-----HHHHHHHH-----E-----E------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------H-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH---HHHH--	+2.8	+4.3	-0.02
prospect	-----------HHHHHHHHHH--------------HHHHH-------HHHHEE----HHHHHHHH-----EE-------HHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--EEEEE--------HHHHHHHH------EEE-------EE-----HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEE-HHHH----HHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE-----HHHHHHHH-----EE--EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-------	+8.0	+15.5	+0.03

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva