EVA results for 1iqp:A

DATE : 2001_09_19
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18...,....19...,....20...,....21...,....22...,....23...,....24...,....25...,....26...,....27...,....28...,....29...,....30...,....31...,....32...,.
seq	SEEIREVKVLEKPWVEKYRPQRLDDIVGQEHIVKRLKHYVKTGSMPHLLFAGPPGVGKTTAALALARELFGENWRHNFLELNASDERGINVIREKVKEFARTKPIGGASFKIIFLDEADALTQDAQQALRRTMEMFSSNVRFILSCNYSSKIIEPIQSRCAIFRFRPLRDEDIAKRLRYIAENEGLELTEEGLQAILYIAEGDMRRAINILQAAAALDKKITDENVFMVASRARPEDIREMMLLALKGNFLKAREKLREILLKQGLSGEDVLVQMHKEVFNLPIEEPKKVLLADKIGEYNFRLVEGANEIIQLEALLAQFTLIGKK
dssp	----HHHHH----HHHH------------HHHHHHHHHHHHH----EEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE---HHHHH--HHHHHHHHH---HHH---EEEEEE-HHH--HHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE--HHH--HHHHH-EEEEE-----HHHHHHHHHHHHH----EE-HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH----EE-HHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH--
apssp	---HHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHH------EEEE------HHHHHHHHHHHH--------HHEE-------HHHHHHHHHHHHHHHH-------EEE-E-HHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE-------HHHHHHHHHHE-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHE--HHHHHHHHHHHHHHHH--	+10.0	+11.5	+0.08
jpred	---HHH------HHHHH------------HHHHHHHHHHHH------EEEE------HHHHHHHHHHHH-------EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE--------HHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH---	+9.1	+16.6	+0.14
phd	---HHH-------HHHH--HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH-----EEEE-------HHHHHHHHHHHH-------EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHH--------EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE-------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH---------EE------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH---	+8.7	+10.7	+0.10
phdpsi	---HHH----HHHHHH----HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH----EEEE-------HHHHHHHHHHHH-------EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEE--------HHHHHHHHHHH----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHE-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH---	+5.3	+10.0	+0.07
prof_king	------------HHHHH-----HHHH---HHHHHHHHHHHHH----EEEEE------HHHHHHHHHHHH--------EEEE-------HHHHHHHHHHHHH--------EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE--------HHHHHHHHEEE-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH---	+8.1	+12.6	+0.12
profsec	---HHH--HHH-HHHHH----HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHH-------EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEE--------HHHHHHHHHH-----EEEEEE-------HHHHHHHHHEEE-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH---	+4.7	+7.9	+0.04
psipred	--HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHH---HHHHHHHHHHHH-----EEEEE------HHHHHHHHHHHH-------EEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEE------HHHHHHHHHHHH-----EEEEEE---HHH--HHHHH--EE-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---	+8.1	+11.1	+0.11
pssp	----EEEEEE-------------HHHH-HHHHHHHHH---------EEEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEHHHHHHHHH--------EEEEEEEHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE------EE--HHHH---EEEE----HHHHHHHHHH--HH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHEE------HHEEE---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+1.7	+4.1	-0.03
samt99_sec	---HHHHHHH---HHHH-----HHHH--HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE------HHHHHHHHHHHH--------EEEE-------HHHHHHHHHHHHH---------EEEEEE--HH--HHHHHHHHHHHHH----EEEEEE--------HHHHHH--EEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----EEEEE----HHHHHHHHHHHHHH--	+5.6	+8.9	+0.08
sspro2	--------H---HHHHH-----HHHH--HHHHHHHHHHHHH-----EEEEE------HHHHHHHHHHHH--------EEEE-------HHHHHHHHHHHHH---------EEEEEE-HHH--HHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE-------HHHHHHHHEEE-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH--	+8.5	+13.9	+0.15

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva