EVA results for 1go4:G

DATE : 2002_05_22
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....1
seq	SSAEQSFLFSREEADTLRLKVEELEGERSRLEEEKRMLEAQLERRALQGDYDQSRTKVLHMSLNPTSVARQRLREDHSQLQAECERLRGLLRAMERGGTV
dssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-E-E--------EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------
apssp	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEE------HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+8.4	-5.0	+0.04
apssp2	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+7.5	0	+0.05
jpred	---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEE-----HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+9.0	-4.8	+0.11
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+4.3	-20.3	-0.10
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+0.7	-23.6	-0.16
profsec	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	-0.5	-4.7	-0.19
psipred	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+11.0	+2.0	+0.12
sspro2	----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+9.0	+22.4	+0.08
prospect_secstruc	-------EE-HHHHHHHHH-HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+11.9	-11.6	+0.06
prospect	-------EE-HHHHHHHHH-HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+10.2	-13.7	+0.04

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva