EVA results for 1gnt:A

DATE : 2002_04_17
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18...,....19...,....20...,....21...,....22...,....23...,....24...,....25...,....26...,....27...,....28...,....29...,....30...,....31...,....32...,....33...,....34...,....35...,....36...,....37...,....38...,....39...,....40...,....41...,....42...,....43...,....44...,....45...,....46...,....47...,....48...,....49...,....50...,....51...,....52...,....53...,....54...,....55..
seq	MFCFQCQETAKNTGCTVKGMCGKPEETANLQDLLIFVLRGIAIYGEKLKELGQPDRSNDDFVLQGLFATITNANWDDARFEAMISEGLARRDKLRNAFLAVYKAKNGKDFSEPLPEAATWTGDSTAFAEKAKSVGILATENEDVRSLRELLIIGLKGVAAYAEHAAVLGFRKTEIDEFMLEALASTTKDLSVDEMVALVMKAGGMAVTTMALLDEANTTTYGNPEITQVNIGVGKNPGILISGHDLKDMAELLKQTEGTGVDVYTHGEMLPANYYPAFKKYPHFVGNYGGSWWQQNPEFESFNGPILLTTNCLVPLKKENTYLDRLYTTGVVGYEGAKHIADRPAGGAKDFSALIAQAKKCPPPVEIETGSIVGGFAHHQVLALADKVVEAVKSGAIKRFVVMAGCDGRQKSRSYYTEVAENLPKDTVILTAGCAKYRYNKLNLGDIGGIPRVLDAGQCNDSYSLAVIALKLKEVFGLDDINDLPVSYDIAWYEQKAVAVLLALLFLGVKGIRLGPTLPAFLSPNVAKVLVENFNIKPIGTVQDDIAAMMAGK
dssp	--E------HHH--E--E-----EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-----E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHH-----HHHHHHHH----HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHH-----EEEE-HHHHHHHH-HHHH----EEEE----HHHHHHHHHHH---EEE--------------HHHEEEE---E----EEE-----------HHHHHHH------------EEEE---HHHHHH-HHHHHHHHHH----EEEE--E-----HHHHHHHHHHHH----EEEEE--HHHHH-------EE--EE-EEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH--EEEEEE---HHHHHHHHHHHH------EEE--------HHHHHHHHHHH--E----HHHHHHHHH---
apssp	--E------HHH--E---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-----E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHH-----HHHHHHHH----HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHH-----EEEE-HHHHHHHH---------EEEE----HHHHHHHHHHH---EEE--------------HHHEEEE---E----EEE-----------HHHHHHH------------EEEE---HHHHHH-HHHHHHHHHH----EEEE--E-----HHHHHHHHHHHH----EEEEE--HHHHH-------EE--EE-EEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH--EEEEEE---HHHHHHHHHHHH------EEE--------HHHHHHHHHHH--EE---HHHHHHHHH---	+23.1	+27.3	+0.55
apssp2	--E------HHH--E--E------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-----E--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHH-----HHHHHHHH----HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHH-----EEEE-HHHHHHHH--HHH----EEEE----HHHHHHHHHHH---EEE--------------HHHEEEE---E----EEE-----------HHHHHHH------------EEEE---HHHHH--HHHHHHHHHH----EEEE--E-----HHHHHHHHHHHH----EEEEE--HHHHH-------EE--EE-EEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH--EEEEEE---HHHHHHHHHHHH------EEE--------HHHHHHHHHHH--E----HHHHHHHHH---	+17	+20.8	+0.44
jpred	----E-E--------EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH--EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHH----EEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------EEEE------EEEE----HHHHHHHHHHH-----EEEEE--------------------------HHHHHHH------EEE----EE----------EEEEEEEE------------------HHHHHHHHH-----------EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEEE---------HHHHHHHH-----EEEEEE---HHHHH---------------------HHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE---------HHHHHHHHHH---------HHHHHHHH---	+3.7	+4.8	+0.02
phd	-----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHH----EE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH----------EEEEEE-----EEEEE---HHHHHHHHHHH----EEEEE--------------------------HHHHHHHHHH----EEEE---E-----------EEEEEEEE-------------------HHHHHHHHH-----------EEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEEE-------HHHHHHHHHHH----EEEEE-------E-EE-----------------HHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH---	+10.4	+5.2	+0.15
phdpsi	------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHH-HHHHHHH------E-------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH--------EEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHH-----EEEE------------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----EEEE---------------EEEEEEEEE----------------HHHHHHHHHHH----------EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEEEE---------HHHHHHHHHH---EEEEEE------E---------------------HHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH---	+3.8	+1.6	+0.02
prof_king	--EEHH-H-------EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHH----HHHHHHHHH----EEEE----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH--H-HHHHHHHHH-----------EEEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHHH---EEEEE-----------HHHHHHHHH----------HHHHHH----EEE----------------EEEEEEEE------------------HHHHHHHHHH----------EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE----------HHHHHHHH----EEEEEE---HHHH----------------------HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---------HHHHHHHHHH---------HHHHHHHHH--	+2.2	-3.1	-0.00
profsec	----HHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH----------EEEEEE-----EEEEE---HHHHHHHHHHHH----EEEE-----------HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH----EEEE---------------EEEEEEEE-----EE----------HHHHHHHHHHH----------EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE----------HHHHHHHH----EEEEE---HHHH-----------------------HHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE---------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH---	+1.2	+0.4	-0.02
psipred	---EEEE--------EE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHH-------HHHHHH-----EE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH------EEEEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHHH---EEEE------------HHH-----EEE--------HHHHH-----EEEE---------------EEEEEEE-------------------HHHHHHHHHH----------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE----------HHHHHHH----EEEEE--HH---HHH--------------------HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EE---------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH---	+1.4	+2.5	-0.02
sspro2	---EE-HHH-----EEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----H-HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HEE----HHHHHHH-----EE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH----------EEEE-------EEEEE---HHHHHHHHHHH----EEEEE----------HHHHH---EE------HHHHHHHHHH----EEEE---------------EEEE----------------------HHHHHHHHHH-----------EEE---HHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE----------HHHHHHHH----EEEEEE---HEEE-------------EEE-----HHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE---------HHHHHHHHHH---------HHHHHHHH---	+4.8	+5.6	+0.04

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: May 1, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva