EVA results for 1dk8:A

DATE : 2000_07_12
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,..
seq	GSASPTPPYLKWAESLHSLLDDQDGISLFRTFLKQEGCADLLDFWFACTGFRKLEPCDSNEEKRLKLARAIYRKYILDNNGIVSRQTKPATKSFIKGCIMKQLIDPAMFDQAQTEIQATMEENTYPSFLKSDIYLEYTRTGSESPKV
dssp	-------HHHHHHH-HHHH---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHH--HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH-HHHHH---HHHH------------
jpred	-------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHH-------	+6.0	+13.3	-0.06
phd	-----HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----HHHH-HHHHHHHHHHH------	+4.8	+14.2	-0.07
phdpsi	-------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH----E------HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHH-HHHHHHHHHHH------	+2.2	+14.8	-0.10
prof_king	------HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHH-HHHHHHHHHH------	+4.5	+13.6	-0.10
profsec	-----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH----HHHH--HHHHHHHHHH------	+1.8	+11.1	-0.13
psipred	------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH----HHH--HHHHHHHHHH------	+9.5	+14.1	+0.02
pssp	---------HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHEE-----EEEE-----HH--HHH--EE-----HHHHHHHHHHHHH------------EEEEE----------	+3.0	+3.3	-0.01
samt99_sec	-----HHHHHH----HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH------	+1.7	+7.3	-0.12
sspro1	-------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH----HHH---HHHHHHH---------	+9.0	+16.9	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Dec 11, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva