Home - sec - acc - cm - fr - con - Bottom

EVA results for 1gd2:E

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,
seq	DQEPSSKRKAQNRAAQRAFRKRKEDHLKALETQVVTLKELHSSTTLENDQLRQKVRQLEEELRIL
dssp	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-
eva3	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.1	-10.0	-0.07
eva4	------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+17.7	+11.2	+0.16
eva5	------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+17.0	+10.9	+0.09
eva6	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+18.7	+11.8	+0.31
jpred	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+17.3	+13.2	+0.05
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+20.4	+14.0	+0.09
phdpsi	--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+16.1	+12.6	+0.05
prof	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+14.5	-8.1	-0.05
psipred	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---	+7.5	-12.7	-0.14
pssp	------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-	+11.1	-1.1	-0.00
samt99_sec	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH	+11.0	+3.4	-0.35
sspro	------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+19.2	+13.7	+0.18

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : abbreviation of prediction method (seq=sequence)
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Home - sec - acc - cm - fr - con - Top