Home - sec - acc - cm - fr - con - Bottom

EVA results for 1g7d:A

DATE : 2000_11_29
TYPE : sec
NRES : 106
HEADER : ENDOCYTOSIS/EXOCYTOSIS
COMPND : MOL_ID: 1;
SOURCE : MOL_ID: 1;
AUTHOR : E.LIEPINSH, S.MKRTCHIAN, M.BARISHEV, A.SHARIPO, M.INGELMAN-

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,.
seq	PGCLPAYDALAGQFIEASSREARQAILKQGQDGLSGVKETDKKWASQYLKIMGKILDQGEDFPASELARISKLIENKMSEGKKEELQRSLNILTAFRKKGAEKEEL
dssp	-----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH-----------
eva3	---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HH---	+4.9	+8.9	-0.03
eva4	---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---HHH---	+5.3	+8.1	-0.05
eva5	---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---HHH---	+3.7	+7.8	-0.14
eva6	---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH----HH---	+6.7	+11.6	-0.00
jpred	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH---------	+12.7	+16.5	+0.11
phd	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHH---	+3.6	-3.5	-0.08
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHH---	+0.8	-5.8	-0.12
prof	---HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------	+6.7	+21.0	-0.03
psipred	---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HH---	+6.9	+9.9	+0.01
pssp	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EE----HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------	+13.1	+16.2	+0.02
samt99_sec	---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---------	+8.2	+6.6	+0.11
sspro	---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---HHH---	+6.8	+10.6	-0.03

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : abbreviation of prediction method (seq=sequence)
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

All results

Last update: Dec 29, 2000
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva
WWW mirrors: ../../../doc/mirrors.html

Home - sec - acc - cm - fr - con - Top