Home - sec - acc - cm - fr - con - Bottom

EVA results for 1f5x:A

DATE : 2000_09_20
TYPE : sec
NRES : 208
HEADER : SIGNALING PROTEIN
COMPND : MOL_ID: 1;
SOURCE : MOL_ID: 1;
AUTHOR : B.AGHAZADEH, M.K.ROSEN, W.E.LOWRY, X.Y.HUANG

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18...,....19...,....20...,...
seq	MKGDEIYEDLMRLESVPTPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFMKPLQRFLKPQDMETIFVNIEELFSVHTHFLKELKDALAGPGATTLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDQVATAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQDATEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKR
dssp	--HHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHH-----HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH--HHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----
eva3	-----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+1.2	-4.6	-0.18
eva4	-----HHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--------HHHH----HHHH-HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+5.5	-1.6	-0.09
jpred	----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---HHHHHHH--HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+3.8	+6.2	-0.14
phd	---------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+3.1	-1.3	-0.13
phdpsi	------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+4.6	-0.0	-0.09
prof	----HHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+6.9	+4.7	-0.04
psipred	---------HHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--------HHHH--HHHHH----HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+2.7	-3.4	-0.16
pssp	----HHHHHHHEE------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHH-HHHHHHHH--EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HH------HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+5.4	-6.9	-0.13
sspro	-----HHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH--------HHHH----HHHH-HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+7.5	+0.8	-0.05

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : abbreviation of prediction method (seq=sequence)
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

All results

Last update: Dec 29, 2000
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva
WWW mirrors: ../../../doc/mirrors.html

Home - sec - acc - cm - fr - con - Top