EVA results for 1s7b:A

DATE : 2004_02_17
TYPE : sec
NRES : 106
HEADER : TRANSPORT PROTEIN
COMPND : 2 MOLECULE: EMRE PROTEIN;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI;
AUTHOR : C.MA, G.CHANG

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,.
seq	IYLGGAILAEVIGTTLMKFSEGFTRLWPSVGTIICYCASFWLLAQTLAYIPTGIAYAIWSGVGIVLISLLSWGFFGQRLDLPAIIGMMLICAGVLIINLLSRSTPH
dssp	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---
apssp2	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------	+4.2	+17.7	-0.13
jufo	EEHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHEE----EEEEEEEEEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------	+1.8	+18.6	-0.07
phd	HHHHHHHHHHHHHHHHEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHH----HHHHHHHEHHHHEEEEEEEE------	-8.1	-4.4	-0.19
phdpsi	HHHHHHHHHHHHHHHHEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHH----HHHHHHHEHHHHEEEEEEEE------	-9.5	-5.6	-0.21
prof_king	HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------	+1.8	+12.7	-0.20
profsec	HHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEHHH-HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE-----	-5.9	+6.8	-0.23
prospect	HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE---HHHHHHEEEEEE-----HHHHHHHHEEEEEEEEEEEEE-----	-11.5	+5.6	-0.17
psipred	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH---EEEEEEEEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	-9.5	+0.4	-0.28
sable	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------	+2.4	+13.4	-0.15
samt99_sec	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------	-1.6	+10.0	-0.25
scratch	HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+0.1	+10.1	-0.22

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Feb 25, 2004
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva