| method | prediction | diff_Q3 | diff_sov | diff_info |
| | ....,....1....,....2....,....3.... |
| seq | EAEFIAGTALTMVGMTLVGLAIGFVLLRVESLVE | | | |
| dssp | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-- | | | |
| apssp2 | ---EE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +4.4 | +20.9 | -0.29 |
| jufo | -----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | -4.7 | +22.5 | +4.90 |
| phd | --HHHHHHHHHHH--EEEEEEHHHHHHHHHHHHH | -3.6 | -17.3 | -0.22 |
| phdpsi | --HHHHHHHHHHH--EEEEEEHHHHHHHHHHHHH | -5.1 | -18.7 | -0.24 |
| prof_king | -EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +3.7 | +25.4 | -0.23 |
| profsec | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE---EEE | +1.5 | +22.4 | -0.04 |
| prospect | ---EE-EEEEEEE-HHHHHHHHHHEEEE-HHHH- | -27.6 | -35.5 | -0.16 |
| psipred | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +12.6 | +19.8 | -0.29 |
| sable | --EEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | -3.9 | +16.5 | -0.28 |
| samt99_sec | HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHHH | +13.0 | -12.8 | -0.33 |
| scratch | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +18.5 | +22.2 | +0.06 |