EVA results for 1izm:A

DATE : 2003_12_02
TYPE : sec
NRES : 170
HEADER : STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
COMPND : 2 MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN HI0817;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HAEMOPHILUS INFLUENZAE;
AUTHOR : A.GALKIN, E.SARIKAYA, C.LEHMANN, A.HOWARD, O.HERZBERG

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....1
seq	LISHSDXNQQLKSAGIGFNATELHGFLSGLLCGGLKDQSWLPLLYQFSNDNHAYPTGLVQPVTELYEQISQTLSDVEGFTFELGLTEDENVFTQADSLSDWANQFLLGIGLAQPELAKEKGEIGEAVDDLQDICQLGYDEDDNEEELAEALEEIIEYVRTIAXLFYSHFN
dssp	---HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHH--HHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
apssp2	--------HHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--------HHEHHHHHHHHHHHHH-------EEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHH--	+9	+7.5	0.00
phd	--HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+10.5	+13.8	+0.06
phdpsi	--HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+8.9	+12.5	+0.04
prof_king	EEE---HHHHHHHH-----HHHHH--HHEEE----------HHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE----------HHHHHHHHHHHHHH------HH--------HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	-0.5	+8.6	-0.10
profsec	-----HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+12.1	+15.9	+0.11
psipred	---HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+12.0	+5.6	+0.17
sable	---HHHHHHHHHH------HHHHH-HHHHHH------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------H-HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+8.2	+2.2	+0.11
samt99_sec	---HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+6.0	+0.8	-0.00
scratch	EEE-HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HH------HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+7.0	+12.9	+0.06

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Dec 10, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva