EVA results for 1nz5:A

DATE : 2003_04_08
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15..
seq	GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDEFKHLKTEAEMKASEDLKEHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHH-----------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----
apssp2	---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+22.4	+29.4	+0.46
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+13.4	+4.7	-0.02
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH---HHHHHHHH------HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+12.6	+8.3	0.00
prof_king	---HHHHHHHHHHHHHH----HH-HHHHHHHHHHH---HHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+13.2	+13.9	+0.02
profsec	---HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+14.3	+17.6	+0.08
prospect	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+19.3	+17.4	+0.20
psipred	---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH-----HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+13.9	+10.8	+0.07
samt99_sec	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+14.6	+9.0	+0.17
scratch	---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+15.1	+25.5	+0.16

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Apr 21, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva