EVA results for 1or7:A

DATE : 2003_04_15
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....1
seq	SHMSEQLTDQVLVERVQKGDQKAFNLLVVRYQHKVASLVSRYVPSGDVPDVVQEAFIKAYRALDSFRGDSAFYTWLYRIAVNTAKNYLVAQGRRPPSSDVDAIEAENFES
dssp	---HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----
apssp2	-----HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHH---	+10.4	+22.6	-0.02
phd	-----HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------	+9.8	+14.4	-0.07
phdpsi	-----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------	+8.7	+12.6	-0.05
prof_king	--------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------	+4.0	+10.7	-0.09
profsec	------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------	+6.5	+9.9	-0.07
prospect	------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH	+6.0	+13.4	-0.18
psipred	----HH--HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------	+6.1	+2.9	-0.10
scratch	--------HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH-------	+9.8	+21.0	+0.03
jufo	-----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------	+7.9	+10.6	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva