EVA results for 1nek:D

DATE : 2003_02_25
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11..
seq	SNASALGRNGVHDFILVRATAIVLTLYIIYMVGFFATSGELTYEVWIGFFASAFTKVFTLLALFSILIHAWIGMWQVLTDYVKPLALRLMLQLVIVVALVVYVIYGFVVVWGV
dssp	---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--
apssp2	--HHHH--------EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE--	+5.5	+2.1	-0.14
phd	-EE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE-	-0.9	-8.2	-0.08
phdpsi	-EE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE-	-3.0	-10.1	-0.10
prof_king	HHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+13.6	+10.8	-0.05
profsec	-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE--	+0.9	+10.7	+0.08
prospect	----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE-----HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE--	+11.0	+12.2	+0.14
psipred	--HHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE--	+9.4	-11	-0.07
scratch	HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE--	+7.7	+12.7	-0.03
jufo	-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--HHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEE-	+0.4	-8.8	-0.07

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva