EVA results for 1lvf:A

DATE : 2002_07_17
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,.
seq	EDPFFVVKGEVQKAVNTAQGLFQRWTELLQGPSAATREEIDWTTNELRNNLRSIEWDLEDLDETISIVEANPRKFNLDATELSIRKAFITSTRQIVRDMKDQMSAS
dssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
apssp	---EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----HHH--------EEEEE---------HHHHHHHHHHHE--HHHHHHH-------	+6.5	+19.8	+0.20
apssp2	----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+12.1	+9.4	+0.13
jpred	----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------	+8.2	+7.2	+0.05
phd	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+15.9	+25.5	+0.09
phdpsi	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+13.2	+23.2	+0.05
prof_king	---EEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+14.4	+23.2	+0.11
profsec	---EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+12.4	+20.6	+0.08
prospect	---EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH---	+10.2	+11.0	+0.13
psipred	----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.0	+19.4	0.00
samt99_sec	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+18.7	+29.1	+0.15
sspro2	---EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH----H---HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+5.8	-9.6	-0.03

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva