EVA results for 1ls7:A

DATE : 2002_06_19
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,
seq	MGFQKFSPFLALSILVLLQAGSLHAAPFRSALESSPADPATLSEDEARLLLAALVQDYVQMKASELEQEQEREGSRIIAQKRACDTATCVTHRLAGLLSRSGGVVKNNFVPTNVGSKAFGRRRRD
dssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH--HHHHHHH------------HHHHHH-HHHHH----------HHHHH-----
apssp	-------HHHHHHHHHHHHH---------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHH--------------------------	+6.5	+19.8	+0.20
apssp2	----HH-HHHHHHHHHHHH---------HHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH-----HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH--------------------------	-9.8	-17.1	-0.28
jpred	------HHHHHHHHHHHHHH----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHH-------------------------	-12.0	-23.4	-0.28
phd	-------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHH------------------------	-4.2	-15.4	-0.20
phdpsi	-------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHH------------------------	-6.9	-17.7	-0.24
prof_king	---H---HHHHHHHHHHHHH-------HHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-H--HHHH----------------HHHHHHHHHHHHH-------------------------	-11.6	-24.7	-0.26
profsec	-------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-------EE---------------	-11.2	-16.3	-0.27
prospect	-------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHHHHH------------------------	-8.6	-5.0	-0.24
psipred	--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHH------HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH------------------------	-14.1	-17.6	-0.32
samt99_sec	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHH----HHHHHHHHHHHHHHHH------------------------	-9.9	-18.9	-0.28
sspro2	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHH----HHHHHHHHHHHHHHH-------------------------	-5.5	-15.6	-0.25

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva