EVA results for 1lj9:A

DATE : 2003_01_21
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...
seq	TDILREIGMIARALDSISNIEFKELSLTRGQYLYLVRVCENPGIIQEKIAELIKVDRTTAARAIKRLEEQGFIYRQEDASNKKIKRIYATEKGKNVYPIIVRENQHSNQVALQGLSEVEISQLADYLVRMRKNVSEDWEFVKKG
dssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH-----HHHHHHHHHH---EEHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEEEE-------EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--
apssp2	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEE-------EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+15.3	+21.6	+0.24
phd	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EEE--------EEEEEE----HHHHHHHHHH----HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+13.1	+13.2	+0.15
phdpsi	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EEEE-------EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+15.2	+23.4	+0.21
prof_king	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH---EEEE------EEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HH----	+12.3	+11.7	+0.16
profsec	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEE------EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+15.8	+22.3	+0.25
prospect	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEE-------EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+16.0	+22.8	+0.23
psipred	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EEE-------EEEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+15.4	+20.1	+0.26
samt99_sec	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--EEE--------EEEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+15.4	+22.9	+0.25
sspro2	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---EEEE-------EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-H--HHHH---	+12.4	+1.9	+0.18

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva