EVA results for 1kr7:A

DATE : 2002_05_15
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....1
seq	MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGHAIDDILSHL
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH---
apssp	---HHHHH-HHHHHHH--------------HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHH-HHHH--	+1.8	+3.9	+0.03
apssp2	---HHHHH-HHHHHHHH---HHHHHH------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHH--	+13.5	+16.2	+0.12
phd	--------HHHHHHHHHH---HHHH-------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+14.6	+18.6	+0.03
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+8.3	+5.9	-0.09
prof_king	---HHH--HHHHHHHHH--HHHHHH-------HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-	+17.6	+17.5	+0.18
profsec	---HHHHHHHHHHHHHHH---HHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-	+11.1	+15.5	-0.00
prospect	---HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-------HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHH---	+15.4	+19.4	+0.08
psipred	---HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH--	+16.9	+26.7	+0.20
samt99_sec	---HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-	+14.4	+14.4	+0.17
sspro2	---EEHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-----EEH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-----H-HHHHHHHH--	+9.2	+23.1	-0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva