EVA results for 1kmi:Z

DATE : 2002_07_24
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,...
seq	SIKPADEHSAGDIIARIGSLTRMLRDSLRELGLDQAIAEAAEAIPDARDRLYYVVQMTAQAAERALNSVEASQPHQDQMEKSAKALTQRWDDWFADPIDLADARELVTDTRQFLADVPAHTSFTNAQLLKIMMAQDFQDLTGQVIKRMMDVIQEIERQLLMVLLSQDQ
dssp	---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH----HHHHHHH---HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------H
apssp	-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	-0.4	-12.4	-0.32
apssp2	------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH	-5.3	-18.3	-0.44
prospect_secstruc	-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH	+6.0	+0.2	-0.23
psipred	----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH	+0.6	-14.9	-0.30
samt99_sec	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-	+1.8	-10.2	-0.32
sspro2	------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH	-0.1	-11.2	-0.31
jpred	-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	-0.6	-19.1	-0.29
prospect	-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH	+6.2	+1.1	-0.22

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva