| method | prediction | diff_Q3 | diff_sov | diff_info |
| | ....,....1....,....2....,....3....,....4. |
| seq | LTDEELVTMSVRELNQHLRGLSKEEIIQLKQRRRTLKNRGY | | | |
| dssp | --HHHHHH--HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----- | | | |
| apssp | ---HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----- | | | |
| apssp2 | --HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH---- | +18.0 | +13.5 | +0.30 |
| jpred | ---HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----- | +19.8 | +15.3 | +0.26 |
| phd | -----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----- | +17.9 | +16.4 | +0.15 |
| phdpsi | -----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----- | +15.2 | +14.1 | +0.11 |
| prof_king | --HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH---- | +16.9 | +12.9 | +0.25 |
| profsec | --HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----- | +19.8 | +11.7 | +0.37 |
| psipred | --HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH---- | +16.9 | +11.0 | +0.28 |
| samt99_sec | --HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-- | +13.1 | +9.7 | +0.17 |
| sspro2 | --HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH--- | +15.8 | +12.0 | +0.22 |