EVA results for 1k05:A

DATE : 2002_01_30
TYPE : sec
NRES : 135
HEADER : TRANSFERASE
COMPND : 2 MOLECULE: FOCAL ADHESION KINASE 1;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
AUTHOR : S.T.AROLD, M.K.HOELLERER, M.E.M.NOBLE

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,
seq	NLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTR
dssp	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----
apssp	--------HHHHHHHHHHHHHHHH----------EE-EHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+6.3	+4.6	-0.14
jpred	-------HHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEEHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+9.2	+21.6	+0.02
phd	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+19.3	+10.7	+0.07
phdpsi	------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+15.0	+9.1	+0.01
prof_king	------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+9.8	-5.1	-0.11
profsec	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+8.9	+6.7	-0.11
psipred	-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+10.5	+7.1	-0.07
sspro2	------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+12.4	+10.4	0.00

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jan 30, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva