EVA results for 1k04:A

DATE : 2002_01_30
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14.
seq	EISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQT
dssp	---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----
apssp	---------------HHHHHHHHHHHHHHHHH----------EE-EHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+6.6	+5.4	-0.10
jpred	---------------HHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEEHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+9.3	+22	+0.06
phd	--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+19.8	+11.8	+0.14
phdpsi	--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------E----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+10.6	+10.3	-0.02
prof_king	---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.2	+8.9	-0.00
profsec	--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+8.2	+7.1	-0.07
psipred	--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+12.5	+10.2	+0.02
sspro2	--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--H-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+12.1	+11.6	+0.03

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva