EVA results for 1juq:A

DATE : 2002_02_27
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15
seq	ESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTVLEACXKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTXALPEEAKIKDAYHXLKRQGIVQSDPPIPVDRTLI
dssp	--HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-HHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---------E-------
apssp	-HHHHHHHHH--------HHHHHHHHH-HHH------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH--------HHH-HHHHHHHHHHEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---EE------------	+3.2	+6.2	-0.10
jpred	-HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----------------	+9.6	+13.0	+0.09
phd	-HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EE------------	+16.5	+19.0	+0.16
phdpsi	-HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH----------------	+12.8	+13.4	+0.09
profsec	--HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----------------	+15.3	+12.1	+0.23
psipred	--HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----------------	+14.0	+11	+0.18
sspro2	--HHHHHHHH--HH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---E---------EE--	+9.8	+3.1	+0.08

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Mar 13, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva