| method | prediction | diff_Q3 | diff_sov | diff_info |
| | ....,....1....,....2....,....3... |
| seq | GIVQQQQQLLDVVKRQQELLRLTVWGTKQEWER | | | |
| dssp | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHH | | | |
| apssp | --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE--HHHHHH | -2.8 | +15.7 | -0.33 |
| apssp2 | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +2.3 | +2.2 | -0.47 |
| phd | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHH | +14.5 | +25.2 | -0.14 |
| phdpsi | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +10.3 | +10.8 | -0.28 |
| profsec | --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +11.2 | +8.6 | -0.26 |
| psipred | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +7.2 | +6.6 | -0.35 |
| sspro2 | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +13.6 | +10.2 | -0.04 |