| method | prediction | diff_Q3 | diff_sov | diff_info |
| | ....,....1....,....2....,....3... |
| seq | GIVQQQQQLLDVVKRQQELLRLTVWGTKEWERK | | | |
| dssp | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHH | | | |
| apssp | --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHHHHHH | +12.3 | -12.9 | -0.26 |
| apssp2 | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +5.4 | +3.4 | -0.44 |
| phd | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHH | +17.6 | +29.6 | -0.06 |
| phdpsi | ---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHH | +7.3 | +21.7 | -0.30 |
| profsec | --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHH | +8.1 | +19.5 | -0.32 |
| psipred | --HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +13.3 | +8.2 | -0.25 |
| sspro2 | -HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH | +16.6 | +11.3 | +0.02 |