EVA results for 1jpb:A

DATE : 2002_01_16
TYPE : sec
NRES : 151
HEADER : OXYGEN STORAGE/TRANSPORT
COMPND : 2 MOLECULE: MYOGLOBIN;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: PHYSETER CATODON;
AUTHOR : P.URAYAMA, S.M.GRUNER, G.N.PHILLIPS JR.

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15
seq	VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGY
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH-----------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--
apssp	---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+11.3	+11.0	+0.11
jpred	---HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+9.8	+6.1	+0.11
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+17.6	+10.4	+0.04
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH-----HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+10.8	+3.7	-0.07
prof_king	---HHHHHHHHHHHHH------H--HHHHHHHHH-----HHHHHH------HHHH---HHHHH--HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+6.2	-8.3	-0.08
profsec	---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+6.4	-2.1	-0.17
psipred	---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+14	+10.3	+0.05
sspro2	---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH-------HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+9.6	+7.9	-0.04

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jan 16, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva