EVA results for 1jp8:A

DATE : 2002_01_16
TYPE : sec
NRES : 152
HEADER : OXYGEN STORAGE/TRANSPORT
COMPND : 2 MOLECULE: MYOGLOBIN;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: PHYSETER CATODON;
AUTHOR : P.URAYAMA, S.M.GRUNER, G.N.PHILLIPS JR.

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15.
seq	VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQ
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHH-----------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---
apssp	---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+13.4	+24.3	+0.16
jpred	---HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+11.9	+16.8	+0.11
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+15.7	+5.8	+0.03
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH-----HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.6	+9.5	-0.02
prof_king	---HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHH-----HHHHHH------HHHH---HHHHH--HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+6.9	+11.9	-0.07
profsec	---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+7.2	+2.5	-0.12
psipred	---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+16.1	+20.4	+0.15
sspro2	---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH------HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.7	+20.8	+0.02

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jan 16, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva