EVA results for 1jfz:B

DATE : 2001_12_19
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....
seq	GMKMLEQLEKKLGYTFKDKSLLEKALTHVSYSKKEHYETLEFLGDALVNFFIVDLLVQYSPNKREGFLSPLKAYLISEEFFNLLAQKLELHKFIRIKRGKINETIIGDVFEALWAAVYIDSGRDANFTRELFYKLFKEDILSAIKEGRH
dssp	-------HHHHH------HHHHHHH-E----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-HHHH-E-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---
apssp	-HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----EEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+14.2	+23.0	+0.06
jpred	--HHHHHHHHHH------HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-----HHHH-----	+7.4	+3.7	-0.02
phd	-HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----E---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+9.2	+5.3	0.00
phdpsi	--HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+11.8	+14.1	+0.09
prof_king	---EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH---HHHHHHHHHH--HHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+10.2	+8.6	+0.03
profsec	--HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH--HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+11.5	+18.7	+0.09
sspro2	-HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH---H-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH----HHEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------	+9.4	+12.8	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva