EVA results for 1jfi:B

DATE : 2001_07_11
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,
seq	DDLTIPRAAINKMIKETLPNVRVANDARELVVNCCTEFIHLISSEANEICNKSEKKTISPEHVIQALESLGFGSYISEVKEVLQECKTVALKRRKASSRLENLGIPEEELLRQQQELFAKARQQQAELAQQEWLQ
dssp	------HHHHHHHHHHH-----E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----E-HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---
apssp	------HHHHHHHHHH-----EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+24.4	+34.4	+0.27
jpred	-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+7.3	+21.2	-0.02
phd	-------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHH-HHHHHHHHHHHHHH----------	+11.1	+12.0	+0.06
phdpsi	------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+13.4	+23.5	+0.03
prof_king	------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHH---	+8.5	+9.4	+0.10
psipred	------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+16.3	+23.7	+0.21
sspro2	---HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+7.7	+19.4	-0.12

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 11, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva