EVA results for 1j7w:B

DATE : 2002_02_27
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,.
seq	MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEAYGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAQGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
dssp	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-HHH-----HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----
apssp	----HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----HHHH---HHHHHH-HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+15.5	+20.2	+0.15
jpred	-----HHHHHHHHHH---------------EEEE----------------HHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH----------HHHH--EEEEEEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	-6.6	-2.9	-0.04
phd	----HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E--HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+14.0	+10.2	+0.03
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+12.4	+8.8	-0.01
profsec	----HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+8.1	+4.1	-0.10
psipred	----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+14.4	+16.1	+0.10
sspro2	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHEE-HHHHHHHH---------HE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+7.3	+9.3	-0.07

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Mar 13, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva