EVA results for 1j7s:B

DATE : 2002_02_27
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,.
seq	MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
dssp	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-HHH-----HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----
apssp	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+17.6	+26.3	+0.17
jpred	-----HHHHHHHHHHH--------HHHH-EEEEE-----------------HHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH----------HHHH--EEEEEEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	-7.3	-0.0	-0.12
phd	----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+11.9	+8.3	-0.02
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+7.6	-2.3	-0.14
profsec	----HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+6.1	+2.3	-0.15
psipred	----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.6	+15.1	0.00
sspro2	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHEE-HHHHHHHH---------HE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+5.3	+6.9	-0.12

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Mar 13, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva