EVA results for 1i4s:A

DATE : 2001_12_19
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,..
seq	MKMLEQLEKKLGYTFKDKSLLEKALTHVSYSKKEHYETLEFLGDALVNFFIVDLLVQYSPNKREGFLSPLKAYLISEEFFNLLAQKLELHKFIRIKRGKINETIIGDVFEALWAAVYIDSGRDANFTRELFYKLFKEDILSAIKEGR
dssp	------HHHHH------HHHHHHHHE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-HHH--E-------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--
apssp	-HHHHHHHHHH------HHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH----EEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+16.1	+24.8	+0.13
jpred	--HHHHHHHHH------HHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-----HHH--------	+5.1	0.0	-0.03
phd	-HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----E---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+8.9	+5.5	-0.01
phdpsi	-HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+10.9	+13.9	+0.07
prof_king	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHH--HHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+10.0	+8.0	-0.00
profsec	--HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH--HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.4	+19.6	+0.07
sspro2	--HHHHHHHHH------HHHHHHHHH---H-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH----HHEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+10.6	+14.7	+0.04

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva