EVA results for 1gu9:B

DATE : 2002_02_20
TYPE : sec
NRES : 173
HEADER : OXIDOREDUCTASE
COMPND : 2 MOLECULE: ALKYLHYDROPEROXIDASE D;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS;
AUTHOR : C.M.NUNN, S.DJORDJEVIC, P.J.HILLAS, C.NISHIDA, P.R.O.DE

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17..
seq	IEKLKAALPEYAKDIKLNLSSITRSSVLDQEQLWGTLLASAAATRNPQVLADIGAEATDHLSAAARHAALGAAAIXGXNNVFYRGRGFLEGRYDDLRPGLRMNIIANPGIPKANFELWSFAVSAINGCSHCLVAHEHTLRTVGVDREAIFEALKAAAIVSGVAQALATIEALS
dssp	-HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
apssp	-HHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----------------EEEE---------HHHHHHHHHHH----EEEEEE-EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	-4.4	+1.4	-0.17
jpred	--HHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----------------EEEE---------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+2.5	+14.6	-0.08
phd	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-EEE------------EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH--HHHEEEHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+7.7	+8.6	-0.01
phdpsi	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+9.3	+7.3	-0.01
prof_king	HHHHHHH-HHHHHHH----EE--------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH---EEEEHH---H--H--------EEEE---------EEEEEHHHHHH----EEE--HHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	-2.2	-4.9	-0.09
profsec	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+6.3	+1.2	-0.10
psipred	-HHHHHH--HHHHHHH---HHH-------HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----EE----------------EEEEE----------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+3.4	+11.8	-0.04
sspro2	-HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH------------------EEEEE--------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+7.4	+1.9	-0.03

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Feb 20, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva