EVA results for 1gu9:A

DATE : 2002_02_20
TYPE : sec
NRES : 172
HEADER : OXIDOREDUCTASE
COMPND : 2 MOLECULE: ALKYLHYDROPEROXIDASE D;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS;
AUTHOR : C.M.NUNN, S.DJORDJEVIC, P.J.HILLAS, C.NISHIDA, P.R.O.DE

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17.
seq	EKLKAALPEYAKDIKLNLSSITRSSVLDQEQLWGTLLASAAATRNPQVLADIGAEATDHLSAAARHAALGAAAIXGXNNVFYRGRGFLEGRYDDLRPGLRMNIIANPGIPKANFELWSFAVSAINGCSHCLVAHEHTLRTVGVDREAIFEALKAAAIVSGVAQALATIEALS
dssp	-HHHHH--HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
apssp	-HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----------------EEEE---------HHHHHHHHHHH----EEEEEE-EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	-3.4	+2.7	-0.15
jpred	--HHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHH--HHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----------------EEEE---------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+2.9	+12.1	-0.05
phd	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-EEE------------EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-----EEE-EHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+5.8	+11.0	-0.03
phdpsi	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+8.0	+6.1	-0.07
prof_king	--HHH---HHHHHHH---EE--------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----EEEEEH---H--H-------EEEEE---------EEEEEHHHHHH----EEE--HHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	-2.3	-5.2	-0.06
profsec	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+6.8	+2.0	-0.09
psipred	-HHHHH--HHHHHHH---HHH-------HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----EE----------------EEEEE----------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+4.5	+12.7	-0.00
sspro2	--HHHH-HHHHHHHHH-HHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH------------------EEEEE--------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+8.4	+4.8	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Feb 20, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva