EVA results for 1ggq:A

DATE : 2001_03_14
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16.
seq	GPNLTEISKKITDSNAVLLAVKEVEALLSSIDEIAAKAIGKKIHQNNGLDTENNHNGSLLAGAYAISTLIKQKLDGLKNEGLKEKIDAAKKCSETFTNKLKEKHTDLGKEGVTDADAKEAILKTNGTKTKGAEELGKLFESVEVLSKAAKEMLANSVKELTS
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH------HHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-
jpred	----HHHEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+6.7	+2.6	+0.02
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+12.6	+15.0	+0.10
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+11.2	+14.8	+0.10
prof_king	---HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+7.1	+3.6	-0.04
profsec	---HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+10.0	+4.1	+0.07
psipred	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHH------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-	+11.5	+16.0	+0.17
pssp	---EEEEE--HH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HH-HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HH---------HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HH---	+14.2	+3.5	+0.13
sspro1	----EEE--HH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH-------HH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+7.3	+6.9	0.00

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva