EVA results for 1gak:A

DATE : 2000_12_13
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,..
seq	FDDVVVSRQEQSYVQRGMVNFLDEEMHKLVKRFRDMRWNLGPGFVFLLKKVNRERMMRYCMDYARYSKKILQLKHLPVNKKTLTKMGRFVGYRNYGVIRELYADVFRDVQGFRGPKMTAAMRKYSSKDPGTFPCKNE
dssp	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHH--HHH----E-
jpred	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH------------	+11.9	+5.2	+0.02
phd	---EE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH--EEEEEE----EEEEEEEEE-----HHHH-HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH-------------	-11.4	-23.2	-0.18
phdpsi	---EE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------	+2.6	-10.9	-0.09
prof_king	---EEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHH------------	+11.0	+10.7	+0.08
profsec	---EEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHH-------------	+7.5	+0.5	+0.01
psipred	----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHH------------	+11.4	+4.8	+0.09
pssp	---EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HH-----HHHHHHEEEEEEE----HHHHHHHHHHHHH--------HHHHH---------------	+11.5	+13.3	+0.1
samt99_sec	---EEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH------------	+10.2	-0.3	+0.07
sspro1	---EEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHH-H---EE----EEEEEEEEHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH------------	-2.9	-8.9	-0.13

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva