EVA results for 1g7d:A

DATE : 2000_11_29
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,.
seq	PGCLPAYDALAGQFIEASSREARQAILKQGQDGLSGVKETDKKWASQYLKIMGKILDQGEDFPASELARISKLIENKMSEGKKEELQRSLNILTAFRKKGAEKEEL
dssp	-----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH-----------
jpred	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH---------	+13.5	+17.1	+0.12
phd	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHH---	+4.1	-2.6	-0.08
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH-HHH---	+1.5	-4.1	-0.12
prof_king	---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH---------	+14.3	+27.1	+0.14
profsec	----HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------	+11.3	+24.7	+0.10
psipred	---HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HH---	+7.8	+11.2	+0.02
pssp	-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EE----HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------	+14.4	+18.2	+0.05
samt99_sec	---HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---------	+9.0	+7.5	+0.13
sspro1	---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH---HHH---	+7.0	+11.2	-0.02

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva