EVA results for 1fnn:A

DATE : 2000_10_04
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18...,....19...,....20...,....21...,....22...,....23...,....24...,....25...,....26...,....27...,....28...,....29...,....30...,....31...,....32...,....33...,....34...,....35.
seq	AIVVDDSVFSPSYVPKRLPHREQQLQQLDILLGNWLRNPGHHYPRATLLGRPGTGKTVTLRKLWELYKDKTTARFVYINGFIYRNFTAIIGEIARSLNIPFPRRGLSRDEFLALLVEHLRERDLYMFLVLDDAFNLAPDILSTFIRLGQEADKLGAFRIALVIVGHNDAVLNNLDPSTRGIMGKYVIRFSPYTKDQIFDILLDRAKAGLAEGSYSEDILQMIADITGAQTPLDTNRGDARLAIDILYRSAYAAQQNGRKHIAPEDVRKSSKEVLFGISEEVLIGLPLHEKLFLLAIVRSLKISHTPYITFGDAEESYKIVCEEYGERPRVHSQLWSYLNDLREKGIVETRQN
dssp	--E--HHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEE------HHHHHHHHHHHH------EEEEEE------HHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-HHH--HHHHHHHHHH---HHHH----EEEEEEE---HHHH---HHHHHHH---EEE----EHHHHHHHHHHHHHHHE------HHHHHHHHHHH-E----------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH-----HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----EEHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH----EEEE-
jpred	--------------------HHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEE-------HHHHHHHHHHHH------EEEE-------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHH-----EEEEEEHHHHHHHH--HHHHHHHH---------EEEEEEE------HHH-----------EEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+7.3	+13.4	+0.08
phd	--EE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEE------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE--------HHHHHHHHHHHH-----EEEEEEEE---HHHHH-------EEEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH-----EEE----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---EEEEE--	+5.0	+12.7	+0.06
phdpsi	-----E-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EEEEEEE-------HHHHHHHHH---E-EEEE----HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH----EEEE---	+10.9	+18.3	+0.19
prof_king	-----HHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEE------HHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHH-----EEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEE-----HHHH--H--------EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-H-HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH------	+10.8	+16.9	+0.17
profsec	--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEEE-----HHHH-HHHH-----EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH--EEEE---	+10.5	+14.7	+0.20
psipred	--EE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEE----HHHHHHHHHHHHHH------EEEEE-------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH------EEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHH--------EEEEEEE---HHHHHHHHHHH----EEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH--EE----	+5.9	+13.4	+0.07
pssp	EEEEEEEE------------HHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE------EEEHHHHHHHHHH---EEEEEEEEEE----HHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---HH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE---HHEE----------EEEEEEE------HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHH----EEE--HHHHH-HHEEEE---HH--------HHHHHHHHHH------EEEEE---HHHHHEEEE--------HHHHHHHHHHHHH-EEEE----	+8.9	+18.8	+0.12
samt99_sec	HHHH----------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEE------HHHHHHHHHHHH------EEEEEE------HHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE--HHHH-HHHHHHHHHHHHH--------EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHH---EEEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----E-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH-EEEE--	+9.3	+9.3	+0.17
sspro1	-EEE----------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------EEEEE------HHHHHHHHHHHHHH----EEEEE-HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHH------EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE----HHHHH--HHHHHH----EEE-----HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH---EE----	+8.9	+15.0	+0.13

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva