EVA results for 1f7c:A

DATE : 2000_12_20
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18.
seq	AQLDSIGFSIIKKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSILMDPETEICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLHLLMNHLAKVADNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPTVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPE
dssp	----HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH---HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH----
jpred	-------HHHHHHHHHHHHH-------EEEE---HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------EEEEE-------------HHHHHHHHHHHHHHH----------	+3.3	+8.5	-0.02
phd	-------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE---HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHEE-----------------HHHHHHHHHHHHHHHH------	+9.9	+14.0	+0.11
phdpsi	-------HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE---HHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHE---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+12.8	+16.4	+0.17
prof_king	-------HHHHHHHHHHHHH----E--EEE----HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHH-HHH-----H-HHHHHHHHHHHHHHHH--HHH------	+11.9	+10.8	+0.13
profsec	-------HHHHHHHHHHHHH-------EEEE---HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------	+10.4	+12.5	+0.11
psipred	-------HHHHHHHHHHHHHH------EEEE---HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------	+12.3	+14.9	+0.14
pssp	---HH--HHHHHHHHEE---------EEEEEEE---HHHHEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHEE-EEEE--EE---HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+4.6	+5.1	-0.03
sspro1	----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE---HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---H----HHHHHHH--H------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+11.4	+9.8	+0.16

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva