EVA results for 1f3v:A

DATE : 2000_09_06
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,...
seq	HEEWVGSAYLFVESSLDKVVLSDAYAHPQQKVAVYRALQAALAESGGSPDVLQMLKIHRSDPQLIVQLRFCGRQPCGRFLRAYREGALRAALQRSLAAALAQHSVPLQLELRAGAERLDALLADEERCLSCILAQQPDRLRDEELAELEDALRNLKCG
dssp	----EEEEEEEEEE------HHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH------EEEEEEEE----EEEEEEEE-HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEE--EEHHHH---HHHHHHHHHH----E---HHHHHHHHHHHHH---
jpred	------EEEEEE-----HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH-----HHHHEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH----	-7.1	-3.7	-0.09
phd	---EEEEEEHHHHHHHHHHEHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---	-13.7	-14.4	-0.1
phdpsi	---EEEEEEEHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH------EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH-HHHHHHHHHHHHHH---	-8.7	-14.0	-0.05
prof_king	-HHH---EEEHHH----EEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH-----EEEEEEE-------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH----	-14.8	-1.8	-0.21
profsec	---EEEEEEEEE---HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-----EEEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH---	-4.8	-6.8	-0.03
psipred	------EEEEEE----HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------EEEEEEEE----EEEEEEEE-----HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH-----	+1.6	+11.2	+0.03
pssp	---EE--EEEEE-----EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH-------EEEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH---	-2.1	-1.9	-0.03
sspro1	-------EEEEEE----HEEE-H-H--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-----EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH----	-10.7	-7.3	-0.16

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Oct 7, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva