| method | prediction | diff_Q3 | diff_sov | diff_info |
| | ....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9 |
| seq | AEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDXIHAENXRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESX | | | |
| dssp | ----------------HHHH---HHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--E------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHH----HHHHHHHHH-- | | | |
| phd | ----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEHHHH------HHHHHHHHHH---HHHHHHH--- | +4.2 | +1.0 | -0.01 |
| phdpsi | -----------------HHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---HHHHHHH--- | +6.0 | +15.8 | +0.01 |
| profsec | ----HHH-HHHH-----HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---HHHHHHH--- | +1.4 | -8.2 | -0.09 |
| psipred | --HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHH-- | -2.8 | -9.6 | -0.09 |
| sspro1 | ----HH--HHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH----HHHHHHHH-- | +6.2 | -11.3 | +0.02 |