EVA results for 1qb4:A

DATE : 2002_05_01
TYPE : sec
NRES : 873
HEADER : LYASE
COMPND : 2 MOLECULE: PHOSPHOENOLPYRUVATE CARBOXYLASE;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI;
AUTHOR : H.MATSUMURA, M.TERADA, S.SHIRAKATA, T.INOUE, T.YOSHINAGA, K.IZUI,

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,....18...,....19...,....20...,....21...,....22...,....23...,....24...,....25...,....26...,....27...,....28...,....29...,....30...,....31...,....32...,....33...,....34...,....35...,....36...,....37...,....38...,....39...,....40...,....41...,....42...,....43...,....44...,....45...,....46...,....47...,....48...,....49...,....50...,....51...,....52...,....53...,....54...,....55...,....56...,....57...,....58...,....59...,....60...,....61...,....62...,....63...,....64...,....65...,....66...,....67...,....68...,....69...,....70
seq	QYSALRSNVSMLGKVLGETIKDALGEHILERVETIRKLSKSSRAGNDANRQELLTTLQNLSNDELLPVARAFSQFLNLANTAEQYHSISPKGEAASNPEVIARTLRKLKNQPELSEDTIKKAVESLSLELVLTAHPTEITRRTLIHKMVEVNACLKQLDNKDIADYEHNQLMRRLRQLIAQSWHTDEIRKLRPSPVDEAKWGFAVVENSLWQGVPNYLRELNEQLEENLGYKLPVEFVPVRFTSWMGGDRDGNPNVTADITRHVLLLSRWKATDLFLKDIQVLVSELSMVEATPELLALVGEEGAAEPYRYLMKNLRSRLMATQAWLEARLKGEELPKPEGLLTQNEELWEPLYACYQSLQACGMGIIANGDLLDTLRRVKCFGVPLVRIDIRQESTRHTEALGELTRYLGIGDYESWSEADKQAFLIRELNSKRPLLPRNWQPSAETREVLDTCQVIAEAPQGSIAAYVISMAKTPSDVLAVHLLLKEAGIGFAMPVAPLFETLDDLNNANDVMTQLLNIDWYRGLIQGKQMVMIGYSDSAKDAGVMAASWAQYQAQDALIKTCEKAGIELTLFHGRGGSIGRGGAPAHAALLSQPPGSLKGGLRVTEQGEMIRFKYGLPEITVSSLSLYTGAILEANLLPPPEPKESWRRIMDELSVISCDVYRGYVRENKDFVPYFRSATPEQELGKLPLGSRPAVES
dssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH---EEEEE------------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEE----E--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHH--HHHHHHHHHHH------EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH----HHH--HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHH--------EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---EEEEEE-HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE----HHH--HHHHHHHHH----------EEEEE-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH--HHHHHH-----------
apssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH---EEEEE------------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE----E--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHH--HHHHHHHHHHH------EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH----HHH--HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHH--------EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH--EEEEEE-HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE---------HHHHHHHHH----------EEEEE-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH--HHHHHH-----------	+23.1	+27.9	+0.56
apssp2	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHH---EEEEE------------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEE----E--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHH--HHHHHHHHHHH------EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH----HHH--HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHH--------EEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH--EEEEEE-HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE---------HHHHHHHHH----------EEEEE-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHH--HHHHHH-----------	+16.1	+20.2	+0.42
phd	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH--EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-------EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH---EEEEE-------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHH------EEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE------------HHHHEEEE-----E-EEEEEE---HHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH---HHH-----------HHH	+12.1	+18.7	+0.13
phdpsi	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH--EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------EEEEEE------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHH-HHH-EEEEEEE---HHHHHHHHHHHHHH-----EEE------HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH---EEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEE------------HHHHHEE--------EEEEE----HHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH---HHHH----------HHH	+10.4	+18.2	+0.12
profsec	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH---EEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEEE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH--EEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHH--EEEEEE----HHHHHHHHHHHH-------EEE-----HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHH---EEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE-----------HHHHHHH---------EEEEE--HHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH---HHHHH---------HHH	+9.2	+15.7	+0.10
psipred	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH---EEEEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------EEEE--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEE--HHHHHHHHHHHH---EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHH-----HHH--HHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHH--HHHH---EEE----HHHHHHHHHHHH---------EE---HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH----EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE----------HHHHHHHH----HHH---EEEEEEHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH--HHHHHH------------	+9.4	+14.6	+0.08
sspro2	-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH-----EEEE---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------EEE---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--H---HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH--EEEEE--H-----HHHHHHHHHHHH----HHH--HHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHH---H---EEEEE----HHHHHHHHHHHHH--------E---HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE-----------HHHHHHH--------EEEEEEE--HHHE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHH---HHHH----------HHH	+8.1	+13.7	+0.06

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: May 1, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva