EVA results for 1ljw:B

DATE : 2002_05_01
TYPE : sec
NRES : 146
HEADER : OXYGEN STORAGE/TRANSPORT
COMPND : 2 MOLECULE: HEMOGLOBIN ALPHA CHAIN;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
AUTHOR : M.K.SAFO, J.C.BURNETT, F.N.MUSAYEV, S.S.NOKURI, D.J.ABRAHAM

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,.
seq	VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
dssp	----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-----HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--
apssp	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH-HHH------HHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+11.5	+21.5	-0.01
apssp2	------HHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH--HHHH--HHH-----HHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH---HHH-HHHHHHHHHHHHHH----	+5.2	-2.0	-0.11
phd	----HHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH---HHHHHHHH-----HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---E--HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+21.9	+21.3	+0.31
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+13.8	+11.5	0.00
profsec	----HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+11.0	+8.5	-0.05
psipred	----HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+10.6	+14.1	-0.03
sspro2	----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHEE-HHHHHHHH---------HE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---	+6.9	+12.5	-0.07

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: May 1, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva