EVA results for 1ljw:A

DATE : 2002_05_01
TYPE : sec
NRES : 141
HEADER : OXYGEN STORAGE/TRANSPORT
COMPND : 2 MOLECULE: HEMOGLOBIN ALPHA CHAIN;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
AUTHOR : M.K.SAFO, J.C.BURNETT, F.N.MUSAYEV, S.S.NOKURI, D.J.ABRAHAM

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14
seq	VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----
apssp	---HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+13.9	+9.6	+0.12
apssp2	---HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH-HH-HHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----	+9.0	+2.6	+0.06
phd	---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH---HHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+20.2	+10.3	+0.19
phdpsi	---HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+14.8	+5.2	+0.10
profsec	---HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+11.2	+2.2	-0.00
psipred	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----	+12.3	+16.7	+0.03
sspro2	---HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHH--HH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--	+7.1	+1.6	-0.09

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: May 1, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva