EVA results for 1ken:B

DATE : 2002_04_24
TYPE : sec
NRES : 175
HEADER : VIRUS/VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
COMPND : 2 MOLECULE: HEMAGGLUTININ HA1;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: INFLUENZA A VIRUS;
AUTHOR : C.BARBEY-MARTIN, B.GIGANT, T.BIZEBARD, L.J.CALDER, S.A.WHARTO,

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....16...,....17...,
seq	GLFGAIAGFIENGWEGMIDGWYGFRHQNSEGTGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRVIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFEKTRRQLRENAEEMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNGTYDHDVYRDEALNNRFQIKG
dssp	----------------------EEEE-------EEE----HHHHHHHHHHHHHHH---------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHHHH----E------E--E-----HHHH--HHH------------HHHHH----
apssp	---------E---E-------EEEEEE----EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE----EEEE------HHHHHHH------HHHHHHHH--------	-9.2	-16.3	-0.10
apssp2	-------------E-------EEEEEE----EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH--EEE----EEEE-----HHHHHHHH------HHHHHHHH--HH----	-12.8	-14.9	-0.20
phd	--HHHHHHHHH--HHH-HHHHHHEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE-----HHHHHHHH------HHHHHHHHH-------	-11.9	-35.0	-0.14
phdpsi	--HHHHHHHHH--HHH-HHHHHHEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE-----HHHHHHHH------HHHHHHHHH-------	-16.1	-38.8	-0.2
prof_king	--HHHHHHHH-----------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH---EEEE-----HHHHHHH--------H-HHHHHH-HHH---	-17.0	-34.5	-0.24
profsec	--HHHHHHHHH------HHHHH-EE---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEE-----HHHHHHH------HHHHHHHHHHH-----	-18.9	-32.4	-0.25
psipred	-HHHHHHHHHH---HHHH--EE-EEE------EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEHHH--HHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHH---HHHHHHH--HHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH---	-23.8	-42.9	-0.32
sspro2	--HHHHHHHE-------E----EE-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEE---HHHHHHHH---------HHHHHHHHHH---	-18.9	-34.1	-0.28

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Apr 24, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva