EVA results for 1juq:C

DATE : 2002_02_27
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....
seq	SLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTVLEACXKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTXALPEEAKIKDAYHXLKRQGIVQSDPPIPVDRTL
dssp	-HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----------------
apssp	-HHHHHHHH--------HHHHHHHHH-HHH------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH--------HHH-HHHHHHHHHHEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH---EE-----------	+7.0	+9.9	-0.03
jpred	-HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH----------------	+12.1	+19.0	+0.16
phd	-HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EE-----------	+20.3	+22.4	+0.26
phdpsi	-HHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH---------------	+15.3	+19.1	+0.16
profsec	-HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----------------	+16.5	+17.0	+0.25
psipred	-HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----------------	+16.6	+15.9	+0.26
sspro2	-HHHHHHHH--HH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHH-HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---E------------	+13.7	+9.7	+0.17

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Mar 13, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva